Minnesanteckning - Lateralt tänkande: Evolutionen, virus och "kulturellt avstånd"

Den här skrev jag på 2010-06-28 och är en form av övning i kreativitet som tråkigt en bit föll bort ifrån p.g.a. dator problem som störde backup mot Blogger. Den var inte avsedd att publiceras - åtminstone inte i den här formen utan är en övning i vad vi kan kalla lateralt tänkande där målet var att se om en annan modell gick att tillämpa egentligen inte primärt på evolutionen men för att ev. ge en bild av tre upplever jag mysterier: ett antal djur i Sydamerika, vissa egenskaper associerade med pingvinen och en del saker associerat med HIV. En primär sak det kanske visade - även om det är svårt att veta säkert när man tittar så här utan att gå igenom det igen - även om det kändes för stort att försöka anteckna klart var att ingenting talade emot "kulturellt avstånd" för Sydamerika.

Det var nu inte avsett att publiceras men jag gör det ändå nu 2010-10-01 p.g.a. en ny studie som knöt ett samband mellan Inkayacu paracasensis - en utdöd pingvin som troligt om jag tolkade det lilla jag läste nu innan övriga släktar från och den var levande i Peru, Sydamerika: Fossilized Giant Penguin Reveals Unusual Colors, Sheds Light on Bird Evolution.

Vidare var den färgglad medan pingvinerna gick svart-vita som vi ju också hade för en del andra djur. Det är en förändring men samtidigt om gruppering av anlag ligger som kort kommenterat längre ner kan detta givet annan forskning ligga i samma grupp för anlag bl.a. rörande immunförsvar och ev. kognitiva anlag där ju svart-vitt respektive röd fläck i mottagande perception överförs via samma väg (vilket inte säger något här men i alla fall är lite intressant) samtidigt som för andra fåglar är en kanske liknande färgteckning (det är svårt att bedöma) visat sig kopplad till motstånskraften mot fågeinfluensa. Det var ju också ursprunget till Spanska sjukan jag sökte där jag antog att influensan var nu och det var den första epidemin och som jag senare skrev:

Pingviner och virussjukdomar
Krokodiler och virussjukdomar?

Jag behöver därför ta mig en titt här igen och givet att det var snart ett halv år sedan behöver jag publicera det.

Det här är viktigt att inse att det är en övning i problemlösning snarare än underbyggda slutsatser rörande virus epidemier o.s.v.

Helt säkert finns fel i det där det är snabba anteckningar medan jag reflekterar problemet initialt.

För att jag inte glömmer bort det lägger jag också direkt till en komplettering rörande Sydamerika:

• Omfattande människooffer har dokumenterats tidigare.
• Vi har nu också från 2010 modernare studier där ev. (och jag säger inte att det funnits) "kulturellt bias" kanske byggda på gamla koloniala bör vara obefintligt som indikerar detta också inklusive offer av barn.

Det är vad som bör spela in känslighet för virussjukdomar. Men Sydamerika som jag ser det är ett mysterium i mycket för flera djur. Troligast hände något ännu dåligt förstått vid några tidpunkter: särskilt från 35 - 45 miljoner år sedan men också senare.

Vi har indikationer om en förändring nu i början av att förstås i Sydamerika ungefär runt det som ett exempel av flera exempel (även om jag tvivlar på att det förklarar vad jag sökte här) på sådant som kan få stor inverkan där det där rörande förändring i temperaturen. Rörande sådant har vi ju också den höga och långa bergskedjan som kan fungera för att buffra djurarter mot förändringar i temperatur och klimat vilket i sig kan addera till ett kulturellt avstånd eller även om det var underbyggt (vilket det inte är) fallerar en sådan motivering som inte tar hänsyn till det.

Konceptet rörande permutationer som begränsar påverkar har dock i princip visats av University of Michigan: Evolutionens komplexitet minskar med organisation av gener. Det motsvar på det sätt som antecknat här (säkert slarvigt):

• Att vi tänker oss arvsanlagen uppbyggda av motsvarande linjära skiftregister (LFSR).
• Varje sådant representerar en permutationsrymd som kan gå i en serie t.ex. påverkas av PTSD m.m. känt för att påverka genuttryck.
• Mutantera vilket permuterar tillståndet.
• Det påverkar dock åtminstone inte direkt andra LFSR.
• Respektive LFSR är kombinerande med varandra för att bygga upp hela arvsanlaget för organismen.
• Kombinationer kan förvisso vara linjära men för att reducera energi och utnyttja värdet av organisation är de icke-linjära formande grafer.

Det är givetvis inte ett vanligt sätt att uttrycka det på men fullt legitimt och kändes då naturligt för mig givet att vi förr (och mindre ofta nu) använde dem för att bygga strömchiffer med i hårdvara - De var aldrig en bra primitiv och där möjligt gör man det givetvis hellre t.ex. med SHA eller rent av MD5 eller ett feistel chiffer kopplat som strömchiffer men det är i samtliga fall rörande information samma sak där endast vår förmåga att uttrycka och beskriva tillstånden ger säkerheten där LFSR är mer naturliga för oss att förstå och analysera - entropi sprider sig dåligt i dem och de läcker naturligt. Därav känner jag väl till dem om än för många år sedan.

Jag lade också till denna kommentar för platsen där dokumentet skadades i samband med IT-problematiken:

"[Red. 2010-10-01. Här skadades uppdateringen till Blogger p.g.a. problem med min dator. Och ett avsnitt saknas. Tråkigt nog råkade jag tappa det här också. Till det sista lade jag ett citat runt men det saknas troligen en bit till efteråt men tankarna och vad jag sökte är inte nya för mig. Och ska jag vara ärlig tycker jag att man allmänt ska ha väldigt stor respekt för att helt undvika stora krig med stumpning, att öka djupt in i djungler och peta runt på isolerade platser i Sydamerika och möjligen centrala delarna av Afrika och åtminstone ha en noggran hälsokontroll av forskarna som återvänder från att ha levt nära vilda fåglar på Sydpolen. Vidare tror jag att det är mycket vådligt att hålla ett stort antal fåglar samlade under stress och trängsel som sker bl.a. i Kina: vem vet de kanske inte bara blir känsligare för virus utan om vi tagit arvsanlag via virus kanske vissa kan uttrycka virussjukdomar de själva är "immuna" mot och att chansen för det ökar när en population är stressad därför att de då kan ha ihjäl konkurrenter lättare. /Hans.]"

Ursprunglig övning i lateralt tänkande

Större variationer i människans gener än förväntat

University of Maryland Medical Center är vad som så många publicerat forskning av hög kvalitet där det antingen är vad man känner starkt bidrar till att bygga den gemensamma pol av värdefull grundkunskap som för världen framåt genom att snabba upp både grund- och tillämpad forskning eller ofta för vad jag pekat är studier som har direkt nytta för många personer genom att se samband runt hälsa.

I den nya studien har vi ett exempel publicerad i Cell (se [1]) har vi ett exempel på det första och intressant för att komplettera diskussionen om Ny modell för Evolutionen med.

I den fallstudien tillämpade jag konceptet för "tid" från min modell för riktad information d.v.s. påverkan och spridning av information (en artikel, annons, insändare, bloggpostning eller en forskningsstudie) på evolutionen för att se hur den klarade av att hantera det. I den diskussionen är följande viktigt att tänka på:

"Varken här eller för immunförsvaret gäller dock att det att modellen är applicerbar bevisar något - jämför med hur Newtons modell för tyngdkraften gör vissa praktiska tillämpningar möjliga men inte säger något om vad tyngdlagen är och i andra situationer t.ex. på månen inte fungerar alls. Inte ens om alla möjligheter jag här pekar på visar sig korrekta bevisar det att teorin modellens applikation på området pekar på är korrekt."

Från: Ny modell för Evolutionen

Jag är heller ingen expert på genetik men försöker passa in vad studien pekar på i den applikationen av min modell. Viktigast av vad man skriver i pressmeddelandet är:

"[...]

Dr. Devine continues: "If you think of the human genome as a manual to build a complex machine like an aircraft, imagine what would happen if you copied the page that describes passenger seats and inserted it into the section that describes jet engines. Transposons act something like this: they copy themselves and insert the copies into other areas of the human genome, areas that contain instructions for the complex machine that is the human body. These areas and the instructions they contain may then become corrupted and hard to understand. This, in turn, can alter human traits or even cause human diseases."

[...]

We saw for the first time that new transposon insertions are happening at a high frequency in each person's genome," Dr. Devine says. "We found that if you have a child, the child could have one or more new copies of these transposons that you don't have. From these findings, we predict that there is going to be more variation in human genomes than scientists first believed."

Från: More Variation in Human Genome Than Expected: Surprisingly Common Transposons or 'Jumping Genes' Are Known to Cause Disease | Sciencedaily

Konceptet är att det ärftliga anlaget bär på ett stycke information (massor av sådana finns) som - om jag tolkade begreppet rätt när jag slog upp det - gör en retrotransposon (lite jämfört med en transposition är intressant och jag kände inte till det innan.

Väljer vi att betrakta DNA och RNA som ett språk (vilket är meningsfullt) kan vi lika gärna tillämpa algoritmer och samband från krypteringsanalys på det och p.s.s. jag använde redundans som begrepp när jag diskuterade tillämpningen av min modell är givet informationsenheten som diskuteras i studien transpositioner och P-boxar meningsfulla och här tror jag det snarast skulle jämföras med en P-box följd av en S-box.

Några varav DES där vi ser hur P-boxarna flyttar om informationen chiffret verkar på hur och S-boxarna substituerar resultatet.

Om förstår funktionen och vad som avses rätt handlar det om informationssegment som gör en permutation genom att sätta in sig och också en substitution av informationen som fanns där och resulterande information bär inte så vitt man vet mer redundans än vad den tillförde annat än när den information som substituerades hade givit upphov till något som inte kommer inträffa där permutationen i någon mening är implicit.

Wikipedia skriver att föreställningen är (eller har varit) att dessa formar mönster i resulterande arvsanlag som säger något om den genetiska historien:

"Alu sequences in primates form a fossil record that is relatively easy to decipher because Alu sequence insertion events have a characteristic signature that is both easy to read and faithfully recorded in the genome from generation to generation. The study of Alu sequences thus reveals details of ancestry because individuals will only share a particular Alu sequence insertion if they have a common ancestor."

Från: Alu sequence

Vad studien dock säger är att det efter ett antal varv med "P- och S-boxar" mellan föräldrarna och ett barn vid någon tid oftare ger ett resultat (jag föreställer mig jämfört ett feistel chiffer) där barnet har nya kombinationen av P- och S-boxar.

Idéen att upprepa permutationer och substitutioner upprepande gånger och att det ger utdata med låg detekterbar redundans skapades inte av Horst Feistel men han studerade det och var med och skapade krypteringsstandarden DES som är ett feistelchiffer (d.v.s. uppbyggd av S- och P-boxar) med 16 varv.

Men har informationen förändras för det? Givetvis kommer ändringarna ibland leda till cancersjukdomar men att dessa kan föranledas av ändringar i DNA veta vi redan och i de flesta fall - eller åtminstone många - finns kända riskfaktorer utanför kroppen nära associerade med sådana där skador uppstår.

Att stora förändringar uppstår behöver varken innebära (även för fallen när resultatet är det enskilda elementet inte längre bär någon information) att resultatet påverkar annorlunda eller att arvsanlagen bär mindre information d.v.s. för det senare behöver mer eller mindre av dessa entiteter inte innebära att den genetiska informationen ökat eller minskat. Antar man däremot att förekomsten av en substitution när den är samtidigt med cancer associerad till denna typ av förändrat DNA kan det dock givetvis verka så även om förändringen i verkligen är mycket vanlig och det misstaget begåtts pekar kanske studien på indirekt eftersom nu förekomsten kan visa sig vara mycket vanligare.

Enklast kan vi se vad fenomenet är genom att betrakta ett förenklat alfabet för DNA som också är var vi startar:

ABCDEFGH

Om varje bokstav representerar i sig ett stycke information som dock är ett generellt byggblock i kroppen representerar det meningsfullt bara vad som går att göra med det oavsett hur komplext det är. Det innebär att för att introducera en meningsfull förändring är det mer effektivt att inducera det genom att istället introducera eller flytta element till exempel:

ABCDEFHG

Därför att om det uttrycker samma meningsfulla information med färre förändringar i hur denna ändring beskrivs är kostnaden för det över tiden mycket lägre. För informationen människan bär byggs informationen upp representerad i kemisk energi och att konkret flytta elementen mellan varandra är dyrt på samma sätt som att det direkt skulle vara dyrt att substituera dem. Att istället förändra ordningen genom att lägga till en indikator i ordningen som säger samma sak är däremot billigt.

En sådan indikator i sig bär information genom att indikera att en permutation skett. Vi kan se det som att C bär betydelsen om och endast om den är på position tre medan den betyder D när den är på position fyra. Att förvandla C till D och D till E sker därför genom att introducera markören. På samma sätt kan uttrycket av övrigt bibehållas genom att introducera en markör som flyttar dem till vänster.

Betraktar vi nu exemplet med den fink vars storlek på näbben förändrats under endast en generation sedan den kom till Galapagosöarna är det så vitt jag kan se omöjligt utifrån det endast traditionella sättet att betrakta evolutionen där naturligt urval i varje generation efter slumpmässiga mutationer eller att individer med särskilda uttryck avlar av sig mer (det skulle här innebära att mer eller mindre alla finkar som den äldre storleken hade avlidit eller inte kunnat avla av sig i vilket fall ingen av dem hade gjort det eftersom detta skedde på mer eller mindre en generation):

"Surprisingly, most of the shift happened within just one generation, the scientists say.

In 1982 the large ground finch arrived on the tiny Galápagos island of Daphne, just east of the island of San Salvador (map of the Galápagos)."

Från: "Instant" Evolution Seen in Darwin's Finches, Study Says | National Geographic

Hanarna och honorna anpassade för ett annat geografiskt område med annan temperatur hade givetvis haft preferenser enligt traditionell evolution för fåglar med den gamla storleken på näbben. Här har dock näbben förändrats på ungefär en generation vilket även om orsaken inte diskuterats helt säkert har med hanteringen av värme att göra.

Antar vi att permutationer uttryckta markörer för upp eller ner i ordningen bär redundans är det dock en väg att förklara det via. Genom det går enormt mycket mer information att uttrycka meningsfullt och det går utan problem i den informationsmängden ha ett onormalt antal av dessa och liknande till synes meningslösa bitar som dock praktiskt uttrycker storleken på alfabetet och dessa gör praktiskt att mycket mer information uttrycks än innan oavsett om de ersätter något och hela uttrycket tycks innehålla meningslösa upprepningar.

Det överskottet av information gör att utan kostnad kan direkt lösningar på vissa saker uttryckas som att en kraftig konstant förändring av temperatur kan lösas genom att uttrycka en större eller mindre näbb. Det är i det fallet troligen bara att lägga till en eller flera markörer före eller efter.

Överskottet av information gör också att det går att uttrycka feedback-funktioner där ordningen i arvsanlagen för fostret fångar detta d.v.s. snarare än att näbben plötsligt blir kortare på finken blir det fostret som får detta. Det är ju också just där som dessa förändringar går att introducera via feedback d.v.s. markörer som kroppen uttrycker i kroppsvätskarna. Mycket av en markör rörande här t.ex. hur mycket fågeln behöver flaxa för att svalka sig (eller hur de gör det) inducerar att fler genetiska markörer läggs till rörande kortare näbb.

Det är en av två förklaringar som jag ser (och måste av andra orsaker inkludera att enorma datamängder som ej används uttrycks vilket kan vara möjligt). Den andra är att storleken på näbben förändrades via en virusinfektion d.v.s. att fågeln på en smittades av ett virus som bär genetiska anlag från här en fågel med kortare näbb. Att arvsanlag kan passera mellan arter är känt och jag tog med exempel i:

Ny modell för Evolutionen

Flera saker talar för att även om den första förklaringen kan vara fallet i mycket (vilket jag tror) är denna möjlig (och det är den jag tror kan gälla här). Specifikt för just Galapagosöarna inte minst att förändringar i arterna tycks ske intensivt oavsett om de kommit direkt till ön eller varit där länge och att förändringarna är mycket stora. Ett intressant exempel är Phalacrocorax harrisi vars vingar inte längre kan användas och istället har fågeln börjat dyka och simma under vattnet:

På Galapagosöarna finns nu också pingvinen Spheniscus mendiculus som huvudsakligen finns på Fernandina Island och västra delarna Isabela Island även om den är utspridd på andra delar av denna övärld.

Foto: Putneymark Licens: CC by-sa 2.0

Båda dessa fåglar är givet den första förklaringen viktiga därför att om permutationer är huvudsakligen informationsdrivande kan det också innebära att det mellan hyggligt nära besläktade arter är mycket lättare för ett virus för att implicit introducera meningsfulla arvsanlag passerade mellan arter.

Det därför att det innebär att varje art redan bär på en enorm information som mycket möjligt kan tänkas spegla mer eller mindre alla egenskaper som redan uppvisat genom evolutionen.

Att just Spheniscus mendiculus kan vara intressant är en prediktion från min modell för riktad information (berörs längre fram) byggd på vad denna indikerade var det djur som var det troligaste ursprunget till H1N1 (spanska sjukan) samt det djur som jag bedömer troligast bär på denna och ev. andra stammar som utvecklats i samma område och troligen samspelat i utvecklat av sådana efterföljande stammar. Samt en möjlighet för hur den svininfluensa som är en variant av spanska sjukan uppstod. Samt vidare en möjlig djurart som kan vara den den äldsta nu levande djurarten som bär på vad en motsvarighet men enormt mycket äldre föregångarna till SIV och HIV. Samt möjlighet också vad som kanske stimulerat den snabbare evolutionen av influensa som kommit de absolut senaste åren. Vidare mycket mer osäkert en möjlig förklaring till hur galna kosjukan uppstod. Samt möjligen en potentiell ny behandling av influensa.

Spanska sjukans karakteristiska drag

Låt oss börja med att betrakta spanska sjukan som är den första influensa vi är säkra på var en influensa. Detta var den värsta influensa vi har haft och dödade cirka 500 000 000 människor ([2]).

Enligt CDC släktar samtliga kända influenser som uppstått därefter från H5N1:

"The impact of this pandemic was not limited to 1918–1919. All influenza A pandemics since that time, and indeed almost all cases of influenza A worldwide (excepting human infections from avian viruses such as H5N1 and H7N7), have been caused by descendants of the 1918 virus, including "drifted" H1N1 viruses and reassorted H2N2 and H3N2 viruses."

Till skillnad från mer eller mindre samtliga övriga uppstod denna också i Frankrike i ett stort läger för franska och engelska soldater mycket nära franska kusten ([3]) och Independant skriver:

"A team of medical scientists has painstakingly trawled through historical records and discovered there was a mysterious respiratory infection at a military base in Etaples, in north-west France, in the winter of 1915-16."

Den blev mycket värre på grund av första världskriget där mängder av soldater mötte varandra i stora läger ofta med skador och nedsatt immunförsvar.

Karakteristiska egenskaper för spanska sjukan var:

1. Den drabbade särskilt barn 0 - 2 år, äldre och personer med nedsatt immunförsvar.

2. Influensan hade ett ovanligt mönster för vilka delar av året den blev mest intensiv och CDC ([2]) skriver:

"However, such factors cannot explain the 3 pandemic waves of 1918–1919, which occurred in the spring-summer, summer-fall, and winter (of the Northern Hemisphere), respectively. The first 2 waves occurred at a time of year normally unfavorable to influenza virus spread. The second wave caused simultaneous outbreaks in the Northern and Southern Hemispheres from September to November. Furthermore, the interwave periods were so brief as to be almost undetectable in some locales."

D.v.s. den var mycket mer intensiv på det europeiska sommarhalvåret 1918 och 1919 vilket är väldigt ovanligt för influensa. Även om den unika situationen rörande kriget är en god förklaring av delar av det är det intressant därför att det visar att spanska sjukan var en väldigt ny genetik där det starkare immunförsvar och i skyttegravar svårare smittspridning under sommaren (bl.a. därför att kroppen har tillgång till mer D-vitamin skapad av solen och färsk frukt oftare som ger C-vitamin) saknade betydelse. Att den inte gjorde någon skillnad mellan barn och äldre visar det också. Inte heller finns några bevis för att influensa överhuvudtaget innan har drabbat människor.

Vad min modell för riktad information indikerade

När jag för någon dag sedan började titta på virus var det som en tredje fallstudie där jag tillämpade den grundläggande dimensionsgruppen i situationer modellen från börjat inte skapats för och då evolutionen och immunförsvaret. Modellen är skapad för påverkan av riktad informationen i den mening att det är information avsedd att påverka någon (t.ex. artiklar, debattartiklar, reklam eller vad du säger till någon) avseende hur den inverkan och hur denna påverkan sprider sig.

Den grundläggande dimensionen avser "tid" men inte i den meningen att det är objektiv och går med konstant fart utan speglar hastigheten som informationen rör sig med (som givetvis kan vara skild mellan olika som talar). I vissa situationer när information utbyts kommer påverkan tendera att bli större vilket kan resultera i nya idéer via ökad kreativitet eller i extrempunkter vad som kallas commotion vilket är en okontrollerbar reaktion.

I båda fallen behöver en signifikant skillnad i den organisation av erfarenhet och kunskap (kultur och kontext) för informationen som utbyts mellan entiteterna. I det andra fallet krävs också att man inte kan eller vill tala med varandra och ett exempel är t.ex. frustrerade ungdomar som tänder eld på bilar.

Att titta på virus efter evolutionen och immunförsvaret kändes meningsfullt eftersom de båda indikerade att det kunde vara möjligt att virus är en viktig del av människans evolution. Även om det skedde med en mycket förenklad variant av modellen var det enklare för de få dimensioner som följdes att hantera virus därför att de både agerar tydligt och snabbt när något sker men i övrigt inte manifesterar sig på ett sätt som inte framgår i nästa smittspridning.

I dessa fall är "extrempunkterna" för virussjukdomar mest intressanta. Vad modellen säger (om den är tillämpbar) är att när stort "kulturellt" avstånd d.v.s. genetiskt avstånd finns mellan virus och djur som det "talar" med kan det både föranleda "kreativitet" d.v.s. att en förändring uppstår hos virus respektive varelse. Emellertid kan också commotion bli fallet och ett fall som vi har det för är spanska sjukan där [4] i Nature föreslår efter att ha infekterat apor med bevarade virus att spanska sjukan resulterade i cytokine storm förklarat i Wikipedia enligt:

"A cytokine storm, or hypercytokinemia is a potentially fatal immune reaction consisting of a positive feedback loop between cytokines and immune cells, with highly elevated levels of various cytokines."

Det är vad som i modellen motsvarar commotion. Över tiden borde dock att reaktionen avta för att uppnå en form av symbios där visst meningsfullt utbyte sker. Att det nödvändigtvis skulle uppstå med människa är självklart vad som kan inträffa senare än med ett annat värddjur som i de kinesiska ankorna där influensa idag anses "övervintra" och utvecklas.

Att de kinesiska ankorna är snabbare att ingå relation bör förklaras av att de hålls i mycket stora flockar. Därmed skapas ett större och snabbare möte mellan virus och värddjur och nödvändiga genetiska förändringar hos en eller båda av dessa kan uppstå. Det bör också resultera i att allvarliga varianter av sjukdomen för dessa värddjur inte längre uppstår. För ankorna har så vitt jag vet inga sådana uppstått under de tidigaste kända åren för influensa vilket vi kommer återvända till.

Vad är ett tillräckligt avstånd mellan virus och människa för att ge spanska sjukan (commotion)?

Ett sätt att skapa en indikation på vad som är ett tillräckligt avstånd mellan ett virus och människa för att kunna orsaka commotion är att jämföra med andra virussjukdomar som åtminstone under dokumenterad tid varit nya.

En sådan är HIV och den är också intressant därför att mycket mer om dess tidiga historia är känd. Det är mycket troligt att den spred sig från en stor apa till människa i Afrika antagligen därför att man åt den som mat.

HIV orsakar inte ett för personen lokalt commotion men däremot spred den sig effektivt. Avståndet virus och människa är därför inte tillräckligt stort när det kommer från en nära besläktad apa.

Vi har också fall av virussjukdomar som givit upphov till mycket kraftiga reaktioner lokalt hos personer eller små samhällen. Inte heller dessa är commotion därför att inte har klarat att växa sig stora utanför det lokala samhället. Det kan förklaras av många saker men samtidigt gäller att Afrika varit bebott väldigt lång tid och åtminstone fram till ev. förändringen nyligen p.g.a. exploatering och motsvarande gäller enligt bl.a. CDC i Emerging Infectious Diseases ([5]) att dessa bär på antikroppar mot flera av de mer kända av dessa som Marburg Virus och personerna arbetar bl.a. med att bryta mineraler och har därför regelbundna kontakter utåt. Även om det inte går att med någon säkerhet spekulera om vad orsaken till vad att dessa virussjukdomar inte blivit globala går de inte här att räkna som commotion innan så skett.

När vi följer upp vad som skett med HIV över tiden har det visat sig att viruset "mutanterar" gång på gång. En annan möjlig förklaring är att viruset givet svagt immunförsvar lättare kan "byta" genetisk information med andra virus och kanske mänsklig genetik. Tolkar man som kan hända med HIV från modellen skulle den antingen förr eller senare gå till commotion eller börja tendera att bli mindre dödlig.

Nu tycks HIV också röra sig mot commotion kanske ganska konstant tills den inträdde i människan men långsamt över tiden därför att den inte överförs lika snabbt mellan människor som t.ex. spanska sjukan och utvecklas långsammare.

Det innebär i så fall att för både HIV och spanska sjukan gäller att det första djuret som bär på smittan och som inte var direkt genetiskt nära stående skiljer ut sig i genetiskt historia mer än för andra virussjukdomar.

Vad är stort avstånd?

Antar vi att stabilitet mellan virus och ett värddjur uppnås via förändringen hos en eller båda av entiteterna kan det ses som i någon mening mer "likriktad" genetik givet att denna ses som mer information innebärande att de mer sällan dödligt kan umgås.

Det är vidare riktigt att antar att det är kommunikation snarare än endast virus som påverkas givet att det visat sig att en ganska stor del av människans arvsanlag ursprungligen kommer från virus. Dr. Sharp som fick Nobelpris för sitt arbete inom genetik pekar på att mer än 50% av människans genetik kan vara viral:

"Yet viruses have not only taken; they have also repaid us in ways we are just beginning to tally. 'Viral elements are a large part of the genetic material of almost all organisms,' said Dr. Sharp, who won a Nobel Prize for elucidating details of our genetic code. Base for nucleic base, he said, 'we humans are well over 50 percent viral.'"

Från: Tiny Specks of Misery, Both Vile and Useful

I modell om ett enskilt virus ska leda till så tydliga avtryck bör de vara resultatet av commotion och vara mycket tydliga i djurens historia. Det tycks också vara fallet för placenta hos däggdjur:

"Dr. Heidmann and his colleagues have discovered that over the past 100 million years, mammals have repeatedly harnessed viruses to make syncytin. 'Wherever we search for them, we find them,' Dr. Heidmann said.

But the syncytin genes we use today may have actually replaced an ancestral one that a virus bequeathed to the very first placental mammals. In fact, that infection may have made the placenta possible in the first place. 'It was a major event for animal evolution,' Dr. Heidmann said."

Från: Hunting Fossil Viruses in Human DNA

Precis som Dr. Hedimann säger krävdes mycket troligt den första infektionen som gav det initiala anlaget för att kunna igenkänna möjligheten och att för göra den meningsfull.

Varifrån virusen som arvsanlagen för att producera det för placentan helt nödvändiga syncytin från är svårare att helt säkert avgöra men möjligheter inkluderar att virus för att gynna sina värddjur tenderar att uppvisa egenskapen. De skulle i så fall kunna tänkas uppstå via mutationer och lättare att sprida sig men en förklaring som känns betydligt mer trolig givet att värdet för värddjuret är extremt långsiktigt innan något värde kan inträffa för virus är att det är arvsanlag dessa tenderar att plocka upp hos djur av samma art eller relativt nära besläktade sådana.

För den första infektionen måste dock avståndet varit mycket större och kan man identifiera ett sådant fall ges också en indikation om vilka djur som är de troligaste kandidaterna för att burit på spanska influensan eller dess direkta genetiska föregångare.

Här kan vi jämföra oss med pungdjuren som gick en annan evolutionär väg.

HIV kan ha varit i commotion

Ett sett man sett på HIV är att varianter av det spridit sig mellan apor från enklare mer österut till högre stående och vidare till människa. Det är med stor sannolikhet också fallet även om man ännu inte med säkerhet följt det så långt bakåt som är möjligt.

HIV-1 - den form som sprider sig snabbast - tros ha skapats när viruset SIVcpz infekterade människa från schimpanser.

Den närmaste evolutionära släkting människan har är troligen schimpansen.

Forskning publicerad i Nature (se [10]) indikerar på att HIV-1 analyserade virussekvensen (ZR59) från år 1959 tagen från en lymfkörtel vilket är den äldsta kända HIV-1 som varit smittsam och den enda som finns bevarad i provtagning tagen före 1976. En viralsekvens från en annan fanns dock bevarad tagen från en vuxen kvinna i Léopoldville i dåvarande Belgiska Kongo (nuvarande Kinshasa) 1960 (detta prov kallas DRC60). Det man såg var att det redan då trots ett år mellan proverna finns genetisk divergens mellan virus i de prover som togs trots att endast ett år fanns mellan dem.

Att skillnaden finns kan ha orsakats av att HIV-1 passerat över till människa många år innan proverna tog eller att HIV-1 mutanterade mycket snabbt vid denna tidpunkt. Den internationella gruppen av forskare gjorde bedömningen att den gemensamma "släkting" dessa två virus haft i människa kan ha funnits någon gång tidigt under 1900-talet:

"Relaxed molecular clock analyses incorporating DRC60 and ZR59 date the most recent common ancestor of the M group to near the beginning of the twentieth century. The sizeable genetic distance between DRC60 and ZR59 directly demonstrates that diversification of HIV-1 in west-central Africa occurred long before the recognized AIDS pandemic."

Likheten mellan DRC60 delar 88% likhet med ZR59. DRC60 togs från en kvinna och ZR59 kom från en man.

HIV tros ursprungligen i människa ha uppkommit i två "oberoende" stammar och det andra är HIV-2 vilket tros ha passerat över från Cercocebus atys (sooty mangabeys) vilken bär på viruset SIVsmm.

Bilden är från Hand-rearing and reintroduction of an infant white-crowned mangabey Cercoce from Flamingo Land Ltd.

Cercocebus atys är till skillnad från de stora aporna mycket mer rörlig i träden och övrigt karakteristiskt för den är (från [] där fler egenskaper har listats):

• Rör sig på marken med fyra ben.
• Är aktiv dagtid.
• Gruppstorlekarna kan vara upp till något under 100 st.
• Männen strövar utanför flocken som byggs upp av honorna.
• En grupp av honor kan ha en "fast" man eller ett fåtal.
• De använder doft för kommunikation också för att kontrollera om honom är brunstig.

Den lever idag i Sierra Leone till Ghana.

Idag finns 11 klassificerade subtyper av gruppen M till HIV-1 och är vanliga i olika delar av världen:

A: Västafrika.
B: Europa, Amerika, Japan, Thailand och Australien.
C: Sydafrika, Indien och Nepal.
D: Normalt endast i östra och centrala Afrika.
E: Tycks endast uppstå rekombinerad med A som CRF01_AE.
F: Centralafrika, Sydamerika och östra Europa.
G: Afrika och centrala Europa.
H: Centralafrika.
I: Är en komplex rekombination av flera subtyper.
J: Huvudsakligen i Central och Väst Afrika och Karibien.
K: Är begränsad till Demokratiska republiken Kongo och Kameroon.

DRC60 liknar mest subtyp A medan ZR59 är associerad (uttryckt från en "avbildning") med subtyp D.

Varianter av HIV har hittats i arvsanlagen hos däggdjuren lemurer (se [8]) som endast finns naturligt på Madagascar och ön "lämnade" Afrika redan för 165 miljoner år sedan ([6])och det är möjligt att den sedan "lämnade" Indien först 80 miljoner år senare ([7]). Hos de tidigare aporna är det dock antikroppar eller virus som hittats.

Lemurerna tros ha utvecklats från en halvapa lik de tillhörande Lorinae vilka idag finns i Indien, India, Sri Lanka och i sydöstra Asien.

Lorinae är en primat i strepsirrhine d.v.s. halvapa i familjen Lorisidae.

Eller att båda arterna har utvecklats från en gemensam föregångare till båda.

Vidare har ytterligare en variant av HIV hittats hos sengångarna som endast finns i Central- och Sydamerika. Varianten

"Dr. Katzourakis and his colleagues discovered hundreds of foamy virus copies in the DNA of the two-toed sloth. They then found the same virus lurking in the genome of the three-toed sloth. Before Dr. Katzourakis’s fossil hunt, scientists had never found a foamy virus infecting any sloths, or any of their relatives like armadillos and anteaters."

Från: Hunting Fossil Viruses in Human DNA

Enligt [9] utvecklades sengångaren från gruppen Xenarthra vilka var däggdjur med placenta:

"Along with anteaters and armadillos, sloths are members of the order Xenarthra—a group of mammals that appeared roughly 60 million years ago. The earliest xenarthrans were arboreal herbivores with simple, stubby teeth, small brains, fused pelvises, and sturdy spines."

I en artikel publicerad i Clinical Microbiology Reviews (se [12]) pekar man på att foamy virus som denna "variant" kallas är den minst karakteristiska av retrovirus och att den inte tycks ge symptom på sjukdom (åtminstone inte hos sengångarna):

"Despite being discovered over 40 years ago, FV are among the least well characterized retroviruses. The replication of these viruses is different in many interesting respects from that of all other retroviruses. Infection of natural hosts by FV leads to a lifelong persistent infection, without any evidence of pathology."

En typisk egenskap för sengångaren är en extremt långsam ämnesomsättning. Sengångare förbränner knappt maten själva utan lever symbiotiskt - liksom människan - med bakterier (men har många fler sådana än vi och annorlunda uttryckt) i matsmältningen som gör en stor del av arbetet med att "smälta" maten till föda kan ta mer än en månad.

Dess metabolism är ungefär hälften den av andra däggdjur med placenta. Kroppstemperaturen är endast 30 °C till 30 °C när den är aktiv och ännu lägre temperaturer när den vilar.

En studie publicerad i Zoological Journal of the Linnean Society pekar tydligt på att de tre kvarstående nu levande sengångarna släktar från föregångare som delade upp sig redan för kanske 40 Myr sedan. Trots det är likheterna mellan dessa båda enorma och man skriver i studien:

"These results imply that the split between the two extant sloth genera is ancient, dating back perhaps as much as 40 Myr, and that the similarities between the two taxa, including their suspensory locomotor habits, present one of the most dramatic examples of convergent evolution known among mammals."

Sengångaren med två tår (Choloepus) och till familjen Megalonychidae. Till samma familj räknas den nu "utdöda" Megalonychid som också har två tår men levde på marken.

Sengångare med tre tår lever dock på marken och dessa är: Megatheriidae, Mylodontidae, Nothrotheriidae och Orophodontidae. I övrigt delar de enorma likheter med Megalonychidae trots att de i evolutionen skilde sig åt redan för 40 Myr sedan.

Samtliga delas in Xenarthra som är en grupp inom däggdjuren som tros ha uppkommit för 60 yr sedan. De första djuren som uppkom i den här gruppen (anses ha dött ut) kunde hoppa mellan träden.

Foto: Stevenj Licens: CC by 2.5 Sengångaren Choloepus hoffmanni har två tår.

Medan Choloepus lever i träden och i nästan allt tycks vara den samma som sengångaren med tre år var Megalonychid marklevande.

Att dessa delades upp för 40 Myr sedan innebär att trots att Choloepus

(two-toed sloths and extinct ground sloths) Deras föregångare kom i tre släktled (two-toed sloths and extinct ground sloths)

Avståndet nödvändigt för HIV

Oavsett om HIV påverkar placenta eller inte har vi i och med sengångaren nu ett möjligt avstånd som är möjligt. Vi har nämligen vad Dr. Heidmann pekade på att däggdjur tenderar att "samla" på sig "virus" för att skapa syncytin:

"Dr. Heidmann and his colleagues have discovered that over the past 100 million years, mammals have repeatedly harnessed viruses to make syncytin. 'Wherever we search for them, we find them,' Dr. Heidmann said.

But the syncytin genes we use today may have actually replaced an ancestral one that a virus bequeathed to the very first placental mammals. In fact, that infection may have made the placenta possible in the first place. 'It was a major event for animal evolution,' Dr. Heidmann said."

Från: Hunting Fossil Viruses in Human DNA

Placenta (moderkakan) är ett tillfälligt organ som bildas hos kvinnan när hon är gravid för att förse fostret med näring och filtrera bort giftiga ämnen som naturligt eller av andra orsaker finns hos modern.

De gifter som kan förekomma i hennes blod kan däribland skapas naturligt hos kvinnan eller orsakas av vad hon äter. Sannolikheten för att det första ska vara fallet på ett sätt som de arvsanlag kvinnan själv inte fick från sina föräldrar är större ju större "genetiskt avstånd" som finns till fadern. Risken för det andra ökar om kvinnan flyttar sig längre bort från områden hon är van att äta i eftersom det alltid finns viss risk att hon kommer äta något olämpligt.

Att samla på sig genetiska anlag för att hantera detta är därför en kritisk faktor för att överleva. Det finns emellertid inget sätt som kvinnan kan göra det på eftersom hon "bara" får arvsanlag från sina föräldrar. Däremot om man antar att dessa former av retrovirus uppfyller ett syfte där det givit värde som både gynnar deras överlevnad och vår har en sådan väg skapats.

När dessa virus smittar samlar vi på oss arvsanlagen. HIV i detta fall tycks mycket anpassad för däggdjur och "smittan" sker vid sex. Vi har också identifierat arvsanlag för "varianter" av HIV hos lemurer vilka anses ha utvecklats från en halvapa lik de tillhörande Lorinae vilka idag finns i Indien, India, Sri Lanka och i sydöstra Asien.

Lemurer kommer därför från en utvecklingsväg som började hos föregångaren till apor och alla halvapor. Vidare har HIV identifierats hos fler däggdjur än apor och halvapor, och dessa virus hör alla till lentivirus och Wikipedia inledda som förklaring av dessa anligt:

"Lentivirus (lenti-, Latin for 'slow') is a genus of slow viruses of the Retroviridae family, characterized by a long incubation period. Lentiviruses can deliver a significant amount of genetic information into the DNA of the host cell and have the unique ability among retroviruses of being able to replicate in non-dividing cells, so they are one of the most efficient methods of a gene delivery vector. HIV, SIV, and FIV are all examples of lentiviruses."

För att förklara ett koncept som skiljer sig ganska mycket på hur man ser på virus just nu och som bitvis nu kan bli lätt osmakligt och också röra våldsamma händelser i människans historia kan det vara lämpligt att förklara vad dessa "virus" är i väldigt små och korta steg. Låt oss börja med vad virologen Keizo Tomonaga vid Osaka University upptäckte:

"Keizo Tomonaga, a virologist at Osaka University, discovered the borna virus DNA by accident. He had been comparing the virus genes with human genes to see if the virus might have evolved to mimic our own proteins. Instead, he discovered four segments of human DNA that clearly had descended from a borna virus gene. 'I was surprised when I found them,' Dr. Tomonaga said."

Samma fyra segment av bornavirus DNA hittades hos både gamla och nya världens apor. Vad är då bornavirus? Det hör till vad som kallas neurotropic virus och de kan föra in genetisk information i nervceller även i centrala nervsystemet.

Människor, gamla världens apor och nya världens apor bär på genetik från bornavirus. Några bevis för att människor har drabbats av sjukdomen som bornavirus orsakar finns inte. Däremot har den drabbat andra varmblodiga djur och ju närmare de levt oss ju troligare tycks det åtminstone vara att sjukdomen ska ha upptäckts hos dem: hästar, kor, får och hundar. Det drabbar dock inte dessa uteslutande eftersom sjukdomen har hittats hos åtminstone rävar.

Låt oss nu gå tillbaka till HUV-1 för ett ögonblick. I utbredningen av olika subgrupperna av HIV-1 i gruppen M vilken är den som spritts mest. Där kan man se att olika subgrupper är mer eller mindre vanliga i olika regioner och den uppenbara men kanske felaktiga tolkningen är att det beror på att en mutation uppstått i viruset som hunnit sprida sig mer i det landet.

Den andra mycket troligt korrekta tolkningen är att människor med olika genetiska egenskaper löper större eller mindre risk att kunna smittas av olika subgrupper till HIV-1. Antar vi att Human Immunodeficiency Virus är virus som anpassat sig för att efterlikna [.]

[Red. 2010-10-01. Här skadades uppdateringen till Blogger p.g.a. problem med min dator. Och ett avsnitt saknas. Tråkigt nog råkade jag tappa det här också. Till det sista lade jag ett citat runt men det saknas troligen en bit till efteråt men tankarna och vad jag sökte är inte nya för mig. Och ska jag vara ärlig tycker jag att man allmänt ska ha väldigt stor respekt för att helt undvika stora krig med stumpning, att öka djupt in i djungler och peta runt på isolerade platser i Sydamerika och möjligen centrala delarna av Afrika och åtminstone ha en noggran hälsokontroll av forskarna som återvänder från att ha levt nära vilda fåglar på Sydpolen. Vidare tror jag att det är mycket vådligt att hålla ett stort antal fåglar samlade under stress och trängsel som sker bl.a. i Kina: vem vet de kanske inte bara blir känsligare för virus utan om vi tagit arvsanlag via virus kanske vissa kan uttrycka virussjukdomar de själva är "immuna" mot och att chansen för det ökar när en population är stressad därför att de då kan ha ihjäl konkurrenter lättare. /Hans.]

He and his colleagues found the same borna virus DNA in apes and monkeys. In other words, borna virus first invaded the common ancestor of humans, apes and monkeys about 40 million years ago.

Från: Hunting Fossil Viruses in Human DNA

"Scientists initially dismissed the viral elements in our chromosomes as so much tagalong 'junk DNA.' But more recently some researchers have proposed that higher organisms have in fact co-opted viral genes and reworked them into the source code for major biological innovations, according to Luis P. Villarreal, director of the Center for Virus Research at the University of California, Irvine."

Från: Tiny Specks of Misery, Both Vile and Useful

[1] Cell, Volume 141, Issue 7, 1253-1261, 25 June 2010
10.1016/j.cell.2010.05.020 Natural Mutagenesis of Human Genomes by Endogenous Retrotransposons
Rebecca C. Iskow, Michael T. McCabe, Ryan E. Mills, Spencer Torene, W. Stephen Pittard, Andrew F. Neuwald, Erwin G. Van Meir, Paula M. Vertino, Scott E. Devine

[2] 1918 Influenza: the Mother of All Pandemics
CDC

[3] Flu epidemic traced to Great War transit camp
Independent.

[4] Aberrant innate immune response in lethal infection of macaques with the 1918 influenza virus
Nature.

[5] Pygmy Populations Seronegative for Marburg Virus.
CDC, Emerging Infectious Diseases.

[6] Only four ancestral mammals survived the perilous journey to Madagascar
NewScientist

[7] Giant palm tree puzzles botanists
BBC

[8] Hunting Fossil Viruses in Human DNA
New York Times.

[9] At the Zoo: Slow and Steady Sloths

[10] Direct evidence of extensive diversity of HIV-1 in Kinshasa by 1960.
Nature.

[11] Sooty Mangabey (Cercocebus atys)
The Primata

[12] Historical Perspective of Foamy Virus Epidemiology and Infection
Clinical Microbiology Reviews

[13] Hunting Fossil Viruses in Human DNA
The New York Times.

[14] Phylogenetic relationships among sloths (Mammalia, Xenarthra, Tardigrada): the craniodental evidence
Zoological Journal of the Linnean Society

Att uttrycka en organisatorisk modell i fler än tre dimensioner

Antalet dimensioner de flesta människor i ögonblicket är medvetna om att de kan föreställa sig samlat är tre stycken. Orsaken till det är att vad vi kan utgå från i en tidpunkt för att fatta beslut är de delar av hjärnan vi har för att ge en fast struktur till arbetsminne där intryck utifrån och allmän information lagrad även utanför dessa strukturer kan verka.

Dessa strukturer är anpassade för att vara användbar i en värld där det fysiska rummet för en entitet i vår storlek praktiskt är tre dimensioner medan tiden för oss modelleras på det sätt som är mest meningsfullt för det fysiska rummet respektive vårt egna tillstånd d.v.s. tid för oss är i mycket anpassat till hur jorden relaterar till solen medan vår förmåga att se tid i övrigt är sådan att en klocka och almanacka ofta är nödvändigt trots att båda också är tämligen rudimentära approximationer av tidsdimensionen.

Det innebär emellertid inte att varken det fysiska rummet, hur vår hjärna fungerar eller hur man mest optimalt betraktar populationer är få-dimensionellt.

Låt oss titta på ett exempel där det sättet att betrakta saker begränsar vad man kan se (även om metoden i sig bör kunna leverera värde jämförbara med andra dyrare begränsade på samma sätt). Vill vi skapa oss en ögonblicksbild av vad folk tycker om något kan vi givet algoritmer för att filtrera data och bedöma kvarstående hämta upp denna från stora sociala nätverk som Twitter och Facebook (där Twitter troligen levererar ungefär på nivå med opinionsundersökningar och är lättare att använda medan Facebook med lite större arbete kan leverera mycket tydligare data än Twitter).

Skapar vi grafer med punkter kan det indikera hur något förändras över tiden och man kan även roa sig med att prediktera framtida punkter. Eftersom snabba förändringar är mer sällsynta än långsamma förändringar (även om snabba också inträffar vilka alltid missas utan att fånga utlösande faktor vilket i denna typ av data sällan är möjlig att se) är det egentligen inte svårare än att ta en linjal och skatta vinkeln på kurvan på den sista biten.

Att prediktera längre än en kort tidpunkt är dock svårt därför att externa faktorer som ej speglas i datat arbetas upp. Även med dessa hamnar man också fel också om man känner den effekt de kommer ha i ögonblicket och vet att dom kommer inträffa. Orsaken är att befintliga redan speglade händelser inte är uteslutande direkt verkande.

Jämför t.ex. med följande projekt där man skapat en algoritm för att detektera tecken på depression i data. Problemet med det är inte att det inte går att se i text. Problemet är att redan när begynnande depression är fallet eller att den är relativt långt gången är motsatta reaktioner möjliga som praktiskt uttrycker optimism. När det försvinner bort blir tecknen dock tydliga men förändringen är redan inträffad.

Vidare säger metoden heller ingenting om antalet användare t.ex. på Twitter som har problematiken om metoden appliceras på en tidpunkt därför att de flesta med problematiken kommer skriva färre tweets eller inga under en period.

Om man låter bli att fastna i konceptet att text ger alla svar blir det möjligt att skapa en bättre lösning. I ett koncept där saker produceras kortfattat oavsett om det är tweets eller som ofta också för bloggpostningar inser vi att hur de produceras i tiden per "mätpunkt" också har betydelse. Fortsätter vi från exemplet med depression inser vi att man från det t.ex. utmärkt kan detektera t.ex. den korta över-energi som vanligt innan depression även när bipolära element är få och korta.

Det blir också möjligt via ett nätverk av typen Twitter att se hur interaktionen mellan mätpunkter ser ut eftersom vad som är betydligt mer signifikant för depression än hur man uttrycker sig är förutom att saker görs långsamt mer sällan att sådan kommunikation minskar.

Vidare vilket för alla praktiska applikationer är mycket viktigare kan man följa hur kulturellt förstärkning sker på världsbilden. Givet att vi är flockdjur är vår världsbild inte vad vi skapar själva utan den är vår tolkning byggd av den världsbild som råder i de flockar vi tillhör. Det är t.ex. denna faktor som jag i min modell för riktad information (artiklar, insändare eller vad som helst som bär syfte) menar är orsaken till att stora företag när de passerat en viss storlek och ålder inte längre klarar att skapa något som tänker nytt utifrån vad de redan har och som inte inkluderar att man köpt något redan bevisat (inget undantag från detta har jag klarat att hitta) även om det givetvis inte innebär att de inte klarar att bygga nya saker med liknande koncept.

I någon mening kan vi se det som att det självklara sättet för oss även när det är sämre att se på världen genom att endast beakta vad vi enkelt kan uttrycka i tre dimensioner där tiden antingen inte alls beaktas (en mätpunkt om än på en tidslinje) eller uttrycks som tillståndsgrafer (t.ex. the hammer).

Det är ett sätt att se på världen skapat från navigation. Vad som händer just nu är oerhört viktigt därför att vi kan kollidera med något. Tiden är endast viktig i den mening att antingen kommer mer tid gå åt för att komma till målet än vad som är meningsfullt eller inte samt ibland om skillnaden tros vara större eller mindre. Det sista är för människan ett oerhört avancerat koncept och det felbedöms därför regelmässigt och ju större flocken är desto större blir felbedömningarna. En mängd organisatoriska system har skapats för att försöka hantera det men eftersom de alla (åtminstone de jag mött) i princip är tre-dimensionella finns ingen egentlig skillnad mellan dem i resultat och oavsett om projektet bygger ett IT-system, ett stridsflygplan, en fabrik o.s.v. blir det vanligen försenat.

Undantaget som finns från det är när det huvudsakligen inkluderar vad som redan i förväg går att uttrycka på ett sätt som skapar en exakt karta (d.v.s. man har gjort nära nog samma sak många gånger tidigare). Det gör att felen går att minska därför att vi kan innan simulera eller emulera färdens väg. Ändå är stora felbedömningar vanliga och ju fler personer som inkluderas desto större blir dom.

Desto mer vi använder exakta kartor för navigation ju mindre nytänkande får vi också och det även när man via egna metoder eller standardiserade system försöker motverka det. Därmed inte sagt att det inte går att motverka även såvida man inte vill riskera det enorma värdet kartan ger (även om det är strukturerade IT-komponenter motsvarande API:er och verksamhetsuppföljning eller om det är ritningar för att bygga hus) gäller att flera metoder behöver kombineras.

Att försöka stimulera riktig kreativitet i en organisation d.v.s. mer än att folk löser problem utifrån den gemensamma (ofta i organisationen lokaliserade) kulturen och först när lösningen ska skapas får indata som är lateral krävs dock att man först att man har en modell för att uttrycka navigation, tid och övrigt som definierar hur vi ser på världen.

Även om man klarar att skapa den mångdimensionellt möter man när den ska formuleras strikt just problematiken att den måste uttryckas som en karta som går att tillämpa mer allmänt. Det tror jag att klarade idag för min modell och en första skiss har vi nedan (även om den knappast som den är uttryckt just nu är meningsfull för någon annan):

Vad vi har är den strukturerade kunskapen i ett bakomliggande rutnät vilket kan ses som en organisation, population eller för en person långtidsminne. Vi har den mångdimensionella tidsdimensionen som uttrycker hastigheten på vad som sker utifrån hur personer påverkas av, påverkar den gemensamma strukturer och för idéer och kunskap till varandra (t.ex. att dokumenterar ett API) i den gemensamma strukturen.

Locomotion uttrycker vad entiteter som hör samman gör som kan uttryckas som en karta och att den är mångdimensionell är kritiskt därför att långsiktigt är det oerhört viktigt om förstockning ska förhindras "ytan" på den strukturerade kunskapen de vidrör i olika punkter av processen (men inte i den mening att större yta i sig skapar något värde utan ev. värde just rörande det har med vad som föranlett det).

I blåa linjer har vi "musiken" vilket är den samlade superpositionen av rörelser vilket indikerar den väg allt som behandlas i modellen rör sig. Den ska bäst inte avvika från det övergripande målet i vilket fall antingen kaos, förlust eller depression uppstår. Vi kan jämföra den med rörelser på en vattenytan eller bättre de luftrörelser som skapas när en flockduvor flyger tillsammans.

Återkopplar vi nu till evolutionen gäller att om långt verkade kommunikation som kan agera snabbt under stress försvinner gäller inte bara att akuta problem inte kan hanteras utan också kommer vi se det problem stora företag drabbas av. Djurarter kan optimeras för en situation och bli bättre och bättre på det men någon ny radikalt idé som påverkar utanför en punkt är oerhört otrolig. Lemurerna på Ceylon är ett exempel på det där de optimerats för varje ekologiskt nisch men ej utvecklats framåt.

Detta kanske man kan uppleva (för ett företag snarare än lemurerna) att internet kan lösa för stora företag men så är inte fallet därför att detta handlar inte om mängden information som går att utbyta utan typ av information och dess möjlighet att påverka och vilken respons den kan ge som uppfattas tillbaka (och flera liknande fenomen). Även för extremfallet där du säger exakt samma sak kommer effekten vara större i person därför att aktivitet när det tas in blir högre genom förstärkning över fler språk.

Detta innebär inte att internet skulle vara ett dåligt verktyg. Tvärtom är det utmärkt för att optimera användningen av "kartor" när praktiska lösningar ska implementeras. Men för att förhindra förstockning där helt nya idéer inte verkar är det inte fullt tillräckligt (jag är dock helt övertygad om att det går att lösa via ett antal metoder där faktiskt några inkluderar internet men på ett sätt där man kan förvänta sig att det stimulerar lateral kommunikation). Längre fram kommer metoder för detta diskuteras mycket mer och troligen gör jag en tillämpning av den större modellen just för att lösa det här problemet (där tillämpningen lika gärna kan vara en stad, ett företagscentrum eller ett helt land även om resultatet av faktisk påverkan skulle skilja sig radikalt beroende på storlek och innehåll i populationen).

Ny modell för Evolutionen

Jag har börjat uttrycka min modell för riktad information (debattartiklar, insändare, annonser m.m.) allmänt uttryckt i olika situationer som en del av arbetet med att få den nu bättre uttryckt i ett mellansteg innan det sker mer exakt och delar implementeras i mjukvara.

En del av det är att försöka att tydligare översätta den till funktioner i hjärnan för att se att den är robust och komplettera de områden där modellen varit ofullständig (t.ex. helhet över text vilket jag kan ha sett en väg för via musiken).

Innan jag ger mig på att försöka göra en översikt av delar av språket modellerat med den djurmodell som skapats från zebrafink (och andra sångfåglar) vars stora likheter (se anteckningarna här en bit ner) med människan rörande ett stort antal områden relaterade till språk som gör dem både lämpliga för detta och att ordentligt kvalitativ forskning finns färdig för kände jag ett behov att betrakta immunförsvaret utifrån ett enkelt men grundläggande koncept i min modell (hastighet eller tid för information).

Zebrafinken är en av de bästa modellerna vi har för viktiga delar av människans språk. Många andra likheter går att se både rörande arvsanlag och beteenden just relaterade till kontinuerligt språk och kanske har arvsanlag antingen explicit eller implicit överförts från fåglar till människor via virus. En stor andel av de virussjukdomar människan drabbas av kommer också direkt eller indirekt från fåglarna.

Detta därför att en möjlighet är att "människan" faktiskt fick "musiken" (avseende inte bara musik utan viktigare förmåga att uttrycka helhet i språk utanför enskilda utrop, gester och ansiktsuttryck) just från fåglarna via virus. Detta både därför att likheterna är stora rörande genetik (men är ej exakta lika för något djur som bär det "unika"), mycket stora likheter finns i språk och beteende.

Det är också redan känt att cirka hälften av människans arvsanlag (olika uppskattningar finns där de lägsta indikerar neråt 5%) kommer från virus och utan genetisk information som kom med en virusinfektion skulle däggdjuren överhuvudtaget inte finnas därför att det är denna som gör att vi klarar att skapa en fungerande placenta där anlag för det kom bornavirus (se referenser i slutet för information om anlag från bornavirus i mänsklig DNA emedan länken går till Statens Veterinärmedicinska anstalt där bornasjukan diskuteras).

Jag gjorde det genom en fallstudie modellens tidsbegrepp "applicerades på immunförsvaret" på Pryltrend utifrån ett särskilt fall: placeboeffekten. Det därför att det kan både peka på problem i min modell relevant för riktad information jag inte sett och ge bättre kunskap om hur modellen översätter ner till hur människan fungerar. Vidare önskade jag också se om den indikerade något rörande immunförsvaret som inte var känt allmänt eller av mig och som kunde vara intressant.

Både rörande att vi kanske fick "musiken" (en egenskap i språket inkluderande musik) från fåglarna och att immunförsvaret delvis mer direkt är intressant för modellen (men indirekt) är också genetisk information intressant att beakta. Nu är min modell varken anpassad för att klara att representera immunförsvaret eller evolutionen och ev. slutsatser som kommer från att tillämpa den här säger i sig självt ingenting även om resultaten kan vara intressanta. Här kan man inte se det som annat än en struktur att organisera annan typ av kommunikation med utifrån vad som är känt och från det göra antaganden om annat som kan vara möjligt. Men att något är indikerat bevisar inte att det är riktigt. En tankelek närmast.

Därför roade jag mig att tillämpa den direkt från modellens enklaste struktur direkt på evolutionen av genetiskt information och se hur det överensstämde med den övergripande modellen för evolution och det uttrycker jag mer samlat här.

Relativ tid är kritiskt för påverkan av all information

Artikeln för immunförsvaret indikerade behovet av att betrakta tid som något icke objektivt i min modell. Ett sätt att förklara det här är att om både du och en entitet uttrycker information till en population och att du har en smalare informationskanal till denna krävs att du uttrycker information mycket snabbare (jämför med hur bredband tillsammans med hur snabbt du kan producera information ut på kanalen och hur snabbt den överför informationen).

Allergori över Sanning och Tid målad av Annibale Carracci.

För en given situation finns heller inte en hastighet som är meningsfull. Även om du uttrycker eller mottar information snabbt existerar också en långsammare tid som behåller mer av vem du är och en kostnad föreligger som begränsar vad du tar in och praktiskt ytterst verkande i upplevd tid (du blir uttråkad och trött och hur snabbt och lätt påverkas också av personlighet och omständigheter utanför informationen).

Evolutionens långsamma tid ger stabilitet

Betraktar vi evolutionen har vi en mycket långsam tid som mycket mer konservativt kommunicerar ut vem du är med små förändringar:

Långsam tid: När bebisar skapas från en man och en kvinna.

Denna är inte 100% konservativ utan förändringar som är meningsfulla, icke meningsfulla eller skadande kan uppstå och det är som all kommunikation en kombination av vad flera uttrycker (annars pratar vi med oss själva vilket också kan ha värde men inte är kommunikation).

En till mekanism i samma tidshastighet är värdet som skapas när individer som är mer genetiskt skilda föder barn (i det extrema fallet hybridvigör för växter eller när inavlade linjer av kor blandas med varandra för en snabbt extra stark avkomma). För Romeo och Julia här målad av Sir Frank Dicksee kanske det hade givit visst utökat värde för deras barn därför att de kom från "krigande" maktfamiljer och deras kärlek var förbjuden. Denna mekanism kräver dock för att verka en över population ett kontinuerligt utbyte som dock i moder tid varit i tillväxt.

Mutationer ger snabb lokal påverkan men långsam spridning

Det finns också en snabb tid lokaliserat i form av mutationer. Dessa kan förändra något snabbt och förändras levnadsomständigheterna radikalt dör vi ut om vi inte klarar av att hantera dem om inte en sådan inträffar som löser problemet och tillräckligt snabbt propagerar ut till populationen.

Mutationer som man ser på evolutionen har dock ingen egen informationskanal. Den kan ibland passera via den långsamma kanalen där anlagen förs över till banren men denna är just oerhört långsam.

En till informationskanal dessa har är den lokaliserade egna kroppen d.v.s. mutationer kan lösa lokaliserade problem mer påverkande personen själv eller de närmaste generationerna. En mutation i immunförsvaret även om denna inte passerar vidare till barn kan mycket väl lösa ett problem för individen eller orsaka ett.

Snabb kommunikation krävs för att lösa snabba stora problem

Däremot ett radikalt snabbt inträffande större avgörande problem påverkande en större population kan mutationer aldrig lösa därför att de är för långsamma (här säger vi helt enkelt att problemet är så pass snabbt). Det enda undantaget man kan föreställa sig är när mutationer via en extern faktor uppmuntras hos en stor befolkning där detta antingen i sig är problemet eller är synkront med detta t.ex. att problemet är radioaktivitet där mutationer som initialt skapas kanske också ger några människor möjlighet att hantera efterföljande lägre strålning (praktiskt inte möjligt för t.ex. kärnvapenexplosioner där alla människor i området dör ut om giftet inte städas bort eller de snabbt flyttas).

Därmed tycks en snabb informationskanal som påverkar stora populationer saknas. Det innebär i så fall att ingen katastrof som påverkar väldigt många av en genetiskt avgränsad grupp någonsin inträffat för nu levande. För de flesta dominerande sådana jag kan föreställa mig skulle dessa heller inte vara enormt avgränsade utan snarast beröra stora delar av en större genetisk grupp (t.ex. att gräsätare dör ut medan trädätare överlever o.s.v.).

Det håller jag för otroligt och att dinosaurierna överlevde genom att transformeras till fåglar är kanske ett exempel på detta. Alla menar att katastrofen kom snabbt och att den påverkade globalt (vi antar så här tillsvidare även att det går att argumentera att katastrofen inte skulle beröra fåglarnas förfäder specifikt t.ex. därför att tillräckligt många befinner sig i luften men det är något att diskutera i kommande inlägg).

Därför måste en till kommunikationskanal för genetisk information existera som både är snabb och når stora populationer direkt. Det behöver också vara en informationskanal som aktiveras naturligt av de situationer som indikerar katastrof.

Likheter mellan sångfåglar, människan, fladdermöss, ekorrar och delfiner

När jag tittade över djurmodellen för språk och inlärning som skapats utifrån zebrafinken blev jag övertygad om att en till sådan kanal finns kritisk för människans utveckling p.g.a. de likheter som existerar mellan de djur som delar vissa egenskaper i FOXP2 (där ge gemensamma egenskaperna i språk och ett flertal andra egenskaper finns). FOXP2 är kort förklarad nedan via ett citat från Wikipedia:

"Forkhead box protein P2 also known as FOXP2 is a protein that in humans is encoded by the FOXP2 gene, located on human chromosome 7 (7q31, at the SPCH1 locus). FOXP2 orthologs have also been identified in all mammals for which complete genome data are available. The FOXP2 protein contains a forkhead-box DNA-binding domain, making it a member of the FOX group of transcription factors, involved in regulation of gene expression. In addition to this characteristic forkhead-box domain, the protein contains a polyglutamine tract, a zinc finger and a leucine zipper.

In humans, mutations of FOXP2 cause a severe speech and language disorder. Versions of FOXP2 exist in similar forms in distantly related vertebrates; functional studies of the gene in mice and in songbirds indicate that it is important for modulating plasticity of neural circuits."

Från: FOXP2

Det gäller så vitt jag vet alla djur som uttrycker kontinuerligt språk som inte är begränsat till ett fåtal uttryck av mer "symbolisk natur" (t.ex. gester, utrop och ansiktsuttryck). Dessa är åtminstone:

• Sångfåglarna.
• Människan.
• Delfiner.
• Ekorrar.
• Fladdermöss.

Likheter hos dessa finns både rörande språk och beteende.

Fladdermöss - flygande däggdjur - kommunicerar kontinuerligt för att uttrycka och förstå rummet. Delfinerna gör ungefär samma sak men "flyger" i vattnet.

Ekorrar är det kanske lustigaste exemplet man inte lätt tänker på. En del av dessa har också utvecklats till att glidflyga. Dessutom har deras "språk" likheter med fåglarna. Ett exempel som visar likheterna i språk ekorrar har särskilt med fåglarna har vi nedan:

Ett till bra exempel som också illustrerar likheterna har vi nedan:

Ett ofta påpekat mysterium i utvecklingen av språket - som jag dock menar är en liten sak jämfört med att klara att få ett nytt radikalt annorlunda koncept som möjliggör språk, bättre spatial förståelse och kanske inspiration till använda armarna på ett annorlunda sätt än benen - är att vårt struphuvud förändrades för att kunna uttrycka ett artikulerat verbalt språk. Här är det värt att peka på att ganska många arter av fåglar kan lära sig härma människor vilket visar att vi har en hel del likheter även i den fysiologiska utformningen. Likheten finns därför åtminstone mellan en del fåglar och människan också för hur vi gör ljud fysiskt och inte bara hur den kanske viktigaste delen av språket - dess "musik" - fungerar i hjärnan.

Foto: Peter Békési Licens: CC by 2.0
Papegojorna - inte bara kända för virussjukdomen papegojsjukan - har tillräckliga fysiologiska likheter med människan för att klara att lära sig härma oss. Dessutom kan de precis som människan sjunga kontinuerliga stycken med musik för att uttrycka sig.

En till likhet är givetvis hur vi använder kroppen. Det handlar för alla (också på sätt och vis delfinerna) om att använda de båda framlemmarna mindre för att transport på marken och mer för att göra något konkret med. Förvissa är det inte unikt för dessa djur men givet att människan tycks slutligen ha rest sig ungefär samtidigt som vi fick en ny komponent i språket (kanske också en bättre känsla för att man kan göra mer med rummet) och de flygande råttor började med det antagligen nära nog med att de fick ett annorlunda kontinuerligt språk är det intressant.

Foto: Luis Miguel Bugallo Sánchez Licens: CC by-sa 3.0
Zebrafinken är en kraftfull djurmodell av människans språk och den har flera spännande likheter i beteende relaterade till när denna typ av språk är viktigaste både för sångfåglar och människor. För båda gäller att honorna blir mer socialt öppna av romantisk musik och båda hör till ett fåtal djurarter som kan sjunga. Dessutom gäller att hanarna både hos zebrafinkar och människor gärna "klär" sig i grälla färger.

Det finns dock en lång rad fler likheter som mycket väl kan vara relaterade till samma genetik som för den gemensamma komponenten i språket och några stycken av dessa tog jag med i anteckningarna rörande detta i väntan på att jag mer noggrant går igenom denna komponent i människans språk och mer exakt måste "se över" zebrafinken som är den mest effektiva djurmodell vi har för människans språk.

Detta är intressant här därför att jag är väldigt övertygad om att detta inte bara är resultatet av parallell evolution även om det helt säkert är avgörande för vilka varianter av djur som överlevt. Utan jag tror att en snabb informationskanaler som kan verka på stora populationer samtidigt möjliggjorde dessa förändringar genom att implicit överföra genetisk information på ett sätt som gjorde att de gick in i arvsanlagen och hos dessa överlevande djurarter resulterade i förändringar som visade sig meningsfulla och ledda fram till något i varje fall vackert och intressant värdefullt för världen: människor, fladdermöss, ekorrar och delfiner (varav åtminstone de tre första och övriga jag känner till är rovdjur som gärna äter ägg och det kan mycket väl också gälla delfiner nära sådana klippformationer där ett otal fåglar häckar eller att de av och till käkar en fågel som dyker ner efter fisk).

Och möjligen också sångfåglarna men det kanske också vara att det nu levande (bort räknat virus) närmast den ursprungliga källan till denna genetiska information.

Genetisk information är nuvarande tillstånd, möjlighet till förändring och redundans

Innan vi direkt berör den möjliga informationskanalen är det oerhört viktigt att förstå genetisk information som begrepp. Det är information som jag utifrån bakgrunden i krypteringsanalysen vill betrakta som redundans eller tom information. Det är antingen information som säger något eller så säger det ingenting.

Vi kan se det som att det inte bara uttrycker vad vi är utan också är feltolerans där feltolerans också är information. Det är också möjligt att information representerar vägar till att hämta in extern information i vilket fall det också är information. Mekanismer för feltolerans tillsammans med att inhämta information möjliggör både förändring och konservering där förändring också kan vara ett exempel på realiserad feltolerans utan att redundans minskat givet att denna informationskanal finns tvärtom kan redundans öka.

Virus kan representera den saknade informationskanalen

När jag följde upp om det var möjligt att genetiskt information hade kunnat passera mellan sångfåglar och människor (ev. mediterat "icke-kausalt" genom att övervintra i länge i informationskanalen t.ex. som virus eller virus information i värddjur där det är realiserat eller icke realiserat) uppmärksammade jag att människan bär på stora mängder genetiskt information som härrör från annat än mutation och vad vi fått från våra föräldrar där New York Times skriver:

"Scientists initially dismissed the viral elements in our chromosomes as so much tagalong 'junk DNA.' But more recently some researchers have proposed that higher organisms have in fact co-opted viral genes and reworked them into the source code for major biological innovations, according to Luis P. Villarreal, director of the Center for Virus Research at the University of California, Irvine."

Från: Tiny Specks of Misery, Both Vile and Useful

De ger också ett exempel där det verkligen tycks vara fallet för alla däggdjurs placenta där den information som härrör från virus är kritiskt. Utan informationen från virus som nu ingår i vårt DNA utvecklas inte ett fungerande placenta och inga däggdjur skulle existera.

Virus kan därför mycket väl vara en den informationskanal som mycket snabbt kan överföra genetisk information påverkande stora populationer och där påverkan åtminstone i vissa fall ger en mycket radikal förändring.

Ett alternativt synsätt är att genetisk information i mänskligt DNA från virus är meningslös och närmast en förorening av vårt DNA som när den blivit för omfattande kommer göra att vi dör bort. Det konceptet är orimligt därför att om det huvudsakligen varje gång detta inträffade var meningslöst hade det givet det antal som det handlar om redan i tiden påverkat immunförsvaret med en hög sannolikhet. Betänk att 40% av DNA lam vara påverkat men även om det endast är några få procent och accepterar att mycket hög redundans är nödvändigt är givet bara däggdjurens ålder relaterat i mutationshastighet för däggdjur kontra virus detta orimligt. Om denna genetiska information minskar redundans i den takt som tycks ha skett hade vi redan sett en kritisk skada som var långsamt realiserade (följ upp vår genomsnittliga livslängd och uppmärksamma att vi nu lever mycket längre än någonsin tidigare d.v.s. genetiska sjukdomar som påverkar senare än de kanske 30 år som vi sannolikt under större delen av vår existens sällan levde mycket längre än gör att nästan vad som helst som är långsamt borde ha hunnits realiseras och spritts ut)

Däremot har jag inte försökt beräkna den faktiska informationstätheten men för att göra det meningsfullt måste den relateras till den entitet som angriper informationen. Defekter kan vi i någon mening se som motsvarande informationsläckage från ett blockchiffer där redundans genom att framgå blir meningslöst. Detta saknar betydelse när detta inte sker med mindre information än vad som krävs för att utnyttjas utan när en entitet har sådan beräkningskraft för att utnyttja det att det troligt tillräckligt ofta blir ett problem som behöver adresseras.

Att virus infekteras oss är i sig exempel om vi antar att det aldrig ger värde på att ett sådant angrepp där beräkningskraften hos virus vida överstiger vad vi har redundans för att klara av därför att dessa kan verka över inte bara multipla människor utan också ett större antal djurarter. Dess evolution är enormt mycket snabbare än vår och det skulle givet antagande om att virus i sig delvis inte också är redundans med värde för oss innebära att enskilda djurarter regelbundet kommer dö ut för att gynna övergripande evolutionär utveckling för virus även om så i andra djurarter. Hastigheten hos andra faktorer som kan snabba upp evolutionen av virus understiger vida all hastighet som redan gång på gång initierats genom historien och representerar ingenting unikt.

Givet att virus saknar kontextuell information skulle dom aldrig själva bromsa detta även om det långsiktigt innebär att alla värddjur dör ut. Detta har inte inträffat och kommer därför heller aldrig inträffa om ingen radikal förändring inträffar (miljöföroreningar kan dock vara det i vilket fall vi troligen är på nedräkning redan).

Virus måste gynna människan

En mekanism måste därför finnas där virus inte bara skadar värdar utan också gynnar dem övergripande för populationen värdar över tiden. Sådant kan visst ses som ett direkt resultat av evolutionen men givet att de ofta kan påverka så många djurarter gissar jag att det snarast är en grundläggande egenskap härrörande tidigt från evolutionen som hängt med. En metod för väldigt enkla organismer - oavsett om de formellt ännu var liv eller inte - att överföra genetiskt information innan vi kopulerade.

Möjligen (vad jag själv tror) var det korta protein segment (motsvarande "prioner") som överförde den informationen och att det utvecklades till att det skedde via virus som en del av den tidiga utvecklingen till komplext liv. I människokroppen tror jag "prioner" än idag fortfarande används som ett informationssystem och att bl.a. cytokinener är ett exempel på det. Idag tror jag virus både kan komma med eller utan "prioner" och att Creutzfeldt-jakobs sjukdom är ett exempel på det senare därför att jag svårt att inse hur prioner kan påverka utan virus givet att människan representerar senare evolutionära entiteter där prioner har ett kontext relaterat till virus d.v.s. jag tror inte att dessa kan binda till celler utan att virus först förändrat cellernas DNA (det tycks för mig rent statiskt vara osannolikt p.g.a. storleken av den information en prion kan representera relaterat till övrigt).

Virus är evolutionens snabba och breda kommunikation

Betraktat på detta sätt är virus en snabb informationskanal som påverkar stora populationer men som agerar korta tidpunkter. Den tillför långsiktigt värde för alla entiteter som deltar i samarbetet.

Vilka djurarter som hamnar i samarbete kan givet resonemanget om redundans (som är svårt att enkelt uttrycka kortfattat) initialt vara slumpmässigt men över tiden optimeras mellan dem där redan överförd genetisk information gör det mindre kostsamt att "testa" att ta in mer information från vad som ligger i mediet d.v.s. att t.ex. fåglar, möss, ekorrar, fladdermöss och människor eventuellt delar ganska stora komponenter av "virusinformation" gör att vi lättare kan låsa upp och testa vad som ligger i "virusmediet" (en mekanism beslutad via slumpmässiga fördelningar snarare än att det beslutas av någon intelligens eller är ett medvetet beslut).

Detta är självklart oerhört riskabelt. Det kan göra oss sjuka och få en mängd personer att avlida därför att detta leder i värsta fall till livshotande virusinfektioner därför att virus går in i cellerna och manipuleras dess DNA eller RNA för att få dessa tillverka fler virus. Men det kan evolutionärt ha varit mer gynnsamt att behålla denna möjlighet än att stänga ner den därför att den innebär en lägre risk för att den enskilda genetiska historiken ska avlida av andra orsaker.

På samma sätt kan det för dessa djurarter vara mer gynnsamt att leva nära inpå varandra. Det gäller för samtliga av exemplen möjligen undantaget delfinerna men kan också lika gärna om man bedömer virus som meningslösa inte ha föranletts av att djurarterna evolutionärt gynnats av närhet via denna mekanism utan av annat och att virussjukdomar långsamt dödar människor, ekorrar, fladdermöss m.m. därför att vi lever nära inpå varandra sedan "evigheter" av dessa orsaker och besmittar varandras DNA och när vi nu allt mer "umgås" med delfinerna snart kommer få både dom och oss att dö ut.

Jag tror dock inte att människan eller något annat djur just dör ut av virus. Däremot kan virussjukdomar som en del av den evolutionära processen döda en mängd människor på vägen därför att värdet av en meningsfull information som ibland överförs den vägen kan vara enormt (det kan faktiskt tänkas motverka ärftliga sjukdomar orsakade av mutationer som i nutid kanske oftare sprider ut sig därför att vi ofta har goda läkemedel både mot dessa och/eller sjukdomar de ökar risken för). Och jag tror det gav oss ett språk där vi kan uttrycka mer än gester, utrop och ljud samt som jag läste tycks det också givit alla däggdjur placenta (utan vilken inget däggdjur skulle existera).

Hur kan virus lösa problem vid katastrofer?

En faktor kvar att adressera är hur intensitet i virus konkret synkroniserar i tid mot intensiv stress där snabb evolution är nödvändig för att vi ska överleva. Det finns flera välkända mekanismer som effektivt påverkar och den första är att stress tillfälligt sätter ner immunförsvaret vilket gör en enorm skillnad i möjligheterna för virus att effektivt infektera oss. Det är också som jag skrev vad som både fångar upp fysiskt och psykisk stress.

Vidare givet att vi accepterat att virus är en evolutionär mekanism gäller också att när en djurart koncentreras i hög koncentration kommer den divergera. Virus stämmer väl in med detta därför att:

1. Många av samma djurart gör att virus mycket lätt sprids.

2. Virus underlättar utveckling till fler djurarter ytterst konkret. Jämför med lemurerna på Ceylon som täckt upp nära nog alla evolutionära nischer som finns.

Foto: Arjan Haverkamp Licens: CC by 2.0
Lemurerna är inte bara intressanta därför att de täckt upp alla ekologiska nischer genom att bilda fler arter utan också därför att man hittat en föregångarna till HIV i åtminstone en av lemurernas DNA. Det gäller en sorts muslemur (men inte den i bilden). Lemurerna kan vi i någon mening se som att ha blivit avskurna från de djur de tidigare kontinuerligt kommunicerade med via virus resultatet av det blev att de även om de spreds ut till fler djurarter inte utvecklades framåt i evolutionen utan de motsvarar vad primaterna var för evigheter sedan.

Snarare än att evolutionen skulle ha avstannat för människan givet om detta resonemang är riktigt står vi därför inför den snabbaste utvecklingen vi haft under överskådlig tid bakåt i historien. Vi kommer få - kanske redan har - en period mycket intensiv fylld av virussjukdomar.

Fågeninfluensan och dess varianter kan komma att orsaka problem men därför att vi konstant - i denna modell - "byter" genetiskt information via virus till och från bl.a. fåglarna är troligen riskerna lägre än för HIV. Vad HIV kommer innebära om den lämnar avtryck som går in i vår gemensamma genetiska pool är oerhört svårt att bedöma. Troligt skulle det dock påverka det centrala nervsystemets funktion snarare än immunförsvarets effektivitet därför att immunförsvaret reglerar det första via återkoppling och den genetiska information som styr detta är kortare än den för t.ex. andra delar och förändringar som påverkar andra delar kan också påverka det första medan jag tror det omvända händer mindre sällan.

I de fall de passeras mellan människor, fåglar, ekorrar, fladdermöss o.s.v. tror jag knappast att det får oss att dö ut. Fågelinfluensan oroar mig därför föga där det också tycks för mig troligt att för känsliga kan de antivirala läkemedel som redan finns t.ex. Tamiflu vara tillräckliga och jag tror inte fågelinfluensan blir mycket värre än vi redan sett.

Däremot för HIV där anlagen kommer från stora primater och ev. övervintrade hos lemurerna innan den återgick i virusmediet till aporna i Afrika och därifrån till människa är riskerna svårare att bedöma. När det skett tidigare har det ofta lett till allvarliga utbrott och jag tror inte människan naturligt utbytt genetiskt information kontinuerligt som med fåglarna. Hur HIV kommer påverka människan om den lämnar genetiskt avtryck i våra arvsanlag återstår att se.

Har HIV lämnat ett avtryck kan det innebära att personen inte insjuknar i vilket fall de genetiska avtrycken kommer gå in i populationen. Om så har det mycket möjligt redan inträffat och vi bör börja se de första exemplen kanske i Kalifornien därför att där finns modern sjukvård, många sjuka och sjukdomen blev tidigt stor.

Påverkan virus har på evolutionen kommer fortsätta

Det lär aldrig någon bli trevligt när virussjukdomar ökar i antal en period men jag har svårt att se att det är särskilt mycket vi kan göra åt det. Läkemedel som kan motverka enskilda virussjukdomar är givetvis viktiga men detta är ett kontinuerligt flöde av snabb information och det lär såvida ingen radikal medicinskt upptäckt sker som föreställer jag mig mer eller mindre måste förändra hur DNA och RNA fungerar i människan fortsätta kontinuerligt även när skadeverkningar av enskilda sjukdomar kan begränsas.

Att isolera oss har heller ingen systematisk effekt om det inte sker orimligt därför vi lever i städerna ytterst nära inpå varandra liksom med fåglarna, ekorrarna och fladdermössen. De är rent av fler än vad vi är.

Men jag tror att virus är bra långsiktigt och att vi kommer få se fantastiska saker (förutom alla kortsiktiga problem) som kommer uppstå under den period av virussjukdomar vi nu får. Det kan både handla om att människan får någon ny egenskap - kanske HIV kommer förändra oss som det ev. förändrade lemurerna så att kvinnorna blir oerhört dominanta flockledare. Eller kanske ekorrarna kommer börja kunna härma människor precis som papegojor och undulater. Eller att några fladdermöss börjar dyka ner i havet för att fånga fisk. Men troligast blir det ingenting vi märker på väldigt länge.

Mer att läsa

Jag var kanske inte denna övning mest intresserad av att direkt tillämpa min modell i ett "felaktigt" kontext där den inte gör mer än att testa det mest basala i den så i någon mening är det också ett litet test av om principen är sund. Det visade den sig vara för immunförsvaret även om det varken där eller här bevisar något och stickproven jag gör är för begränsat för heller säkert säga något.

Här tycks jag i alla fall inte se något som talar emot principen och helt säkert har virus tillfört stort värde vid några tillfällen.

Först har vi några exempel på att man konkret identifierat genetiskt information i DNA som kommer från virus. Ingen möjlighet finns att ta ett stycke information i DNA och endast från det veta om det är från ett virus utan man måste jämföra med kända virus och hur mycket av vår DNA som är virus eller även om det finns i virus faktiskt från början kommer från oss går därför inte att med säkerhet att bedöma under överskådlig framtid.

Hunting Fossil Viruses in Human DNA
The New York Times.

Human Genome Bears a Virus Related to HIV-1.
Howard Hughes Medical Institute.

I, virus: Why you're only half human
New Scientist Life.

Evolutionary Surprise: Eight Percent of Human Genetic Material Comes from a Virus
Sciencedaily.com.

Här har vi också illustrerat mekanismen jag föreslog existerade där genetisk information kan ses som nycklar till annan information:

Virus works with gene to cause Crohn's-like illness
EurekAlert!, AAAS.

Ovan resulterar det i sjukdom och det kommer det givetvis ofta gör därför att det finns ingen i varje enskilt fall särskild intelligens som klarar att bedöma effekten av sådant utan det följer statistiska fördelningar där dessa övergripande övertiden kommer gynna samtliga entiteter som deltar i kommunikationen (människa, virus och övriga som "talar" med varandra över kanalen).

I exemplet nedan vilket jag blev enormt glad över att jag hittade därför att lät bli att öppna upp det flera gånger när jag sökte efter studier har vi ett exempel på hur människan lägger ut information i kanalen i form av virus (på det sätt som min modell betraktar det medan andra modeller kan se det på annat sätt):

"The USF team also confirmed preliminary results by other investigators that, a long time ago, the virus inserted its DNA into the DNA of human sperm and egg cells. As a result, some people (about 1 percent of people in the U.S.) are born with the virus's DNA in every cell in their body. Indeed, HHV-6 is the first functional virus of any type reported to be passed through the human germ line.

The team presented clear evidence that the virus can insert its DNA specifically into telomeres – structures at the ends of each chromosome that play key roles in both aging and cancer.

Finally, the team showed that the chromosomally integrated HHV-6 (CIHHV-6) genomes can be reactivated to an infectious form.

The findings are a surprise, since other human herpesviruses cause permanent infection by a different mechanism. The round up their DNA into a little circle that resides inside the nucleus of the cell: they do not insert their DNA into the chromosomes."

Från: Herpes Virus Can Integrate its DNA into Human Chromosomes

En mycket trevlig fallstudie. En mycket bra dag i övrigt också. Endast slagen av att modellen klarade identifiera en kända franska författaren Alexandre Dumas utifrån en roman (i svensk översättning) som extrem kaffedrickare vilket i alla fall viss dokumentation tycks peka på stämmer (vilket jag möjligen kommer förklara hur därför att det berör en faktor jag lärde mig från forskning som publicerats om zebrafinkarna tillsammans med några antaganden). Modellen tycktes dessutom gå att applicera utan några enorma problem på immunförsvaret testat precis som har endast på en grundläggande idé.

Den stora författaren Alexander Dumas är trevlig att läsa genom hans härliga konstanta överdrivande av vissa mänskliga egenskaper på ett ganska ovanligt sätt samt hans texts snabba musik men ändå i segment korta rörande en särskild i romaner vanlig litterär konstruktion.

Varken här eller för immunförsvaret gäller dock att det att modellen är applicerbar bevisar något - jämför med hur Newtons modell för tyngdkraften gör vissa praktiska tillämpningar möjliga men inte säger något om vad tyngdlagen är och i andra situationer t.ex. på månen inte fungerar alls. Inte ens om alla möjligheter jag här pekar på visar sig korrekta bevisar det att teorin modellens applikation på området pekar på är korrekt.